服务项目 - Run2AI · AI智能生信分析平台

转录组数据分析

适配基础医学、农学课题

分析内容

✓ 原始数据质控与过滤
✓ 差异表达基因筛选
✓ GO/KEGG富集分析
✓ 火山图、热图、MA图
✓ 蛋白互作网络（PPI）
✓ 完整结题报告交付

交付成果

✓ 差异基因列表与注释表
✓ 火山图、热图、MA图（矢量）
✓ GO/KEGG富集圈图
✓ 标准化表达矩阵
✓ 可编辑矢量图源文件
✓ 完整结题报告PDF

微生物组分析

16S/ITS/宏基因组

分析内容

✓ 测序数据质控与去噪
✓ OTU/ASV聚类与物种注释
✓ Alpha/Beta多样性分析
✓ 物种组成柱状图
✓ 功能富集预测（PICRUSt2等）
✓ 组间差异物种分析

交付成果

✓ 物种注释与丰度表
✓ 多样性指数汇总
✓ PCoA/NMDS排序图
✓ 物种组成与差异图（矢量）
✓ 功能预测结果
✓ 完整结题报告PDF

代谢组数据分析

定性定量、通路分析、代谢物互作

分析内容

✓ 代谢物定性定量分析
✓ 多元统计分析（PCA/PLS-DA/OPLS-DA）
✓ 差异代谢物筛选
✓ 代谢通路富集分析
✓ 代谢物互作网络构建
✓ 代谢通路映射图

交付成果

✓ 差异代谢物列表
✓ 多元统计得分图（矢量）
✓ 火山图与VIP图
✓ 代谢通路富集图
✓ 代谢物互作网络图
✓ 完整结题报告PDF

核心主推

单细胞测序分析

平台核心主营：单细胞转录组标准化全套分析

概念说明

单细胞测序为大类统称，涵盖单细胞转录组、单细胞ATAC、空间转录组等技术方向。Run2AI平台核心主营为单细胞转录组标准化全套分析，同时可定制单细胞ATAC、多组学联合分析方案，满足不同科研场景需求。

适用场景

肿瘤免疫微环境

发育生物学

干细胞分化

神经科学研究

临床样本分析

SCI高分机制课题

完整标准化分析流程

1 原始数据质控

Cell Ranger比对定量，低质量细胞过滤

2 比对定量

参考基因组比对，基因表达矩阵生成

3 标准化均一化

LogNormalize，高变基因筛选

4 降维聚类

PCA/tSNE/UMAP降维可视化

5 细胞分群与标记基因

FindClusters/FindMarkers，标记基因筛选

6 细胞类型注释

基于标记基因的细胞类型自动/手动注释

7 亚群差异分析

亚群间差异基因筛选与功能注释

8 GO/KEGG/GSEA富集

功能富集分析，GSEA通路活性评估

9 轨迹拟时序分析

Monocle/Slingshot细胞命运轨迹推断

10 细胞通讯互作分析

CellChat/NicheNet配体-受体互作网络

交付成果

UMAP/tSNE分群图

细胞分群可视化，适配SCI投稿

细胞比例图

各样本/分组细胞占比统计

气泡图/小提琴图

标记基因表达模式展示

轨迹图

细胞分化/状态转换路径

细胞通讯网络图

配体-受体互作可视化

富集圈图

GO/KEGG/GSEA功能富集

标准化矩阵与基因列表

完整数据文件，可二次分析

可编辑矢量图

PDF/SVG格式，自由调整

完整结题报告

方法+结果+图表，直接用于论文

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公共数据挖掘

GEO/TCGA数据库，无自有测序数据也可发文

分析内容

✓ GEO/TCGA数据检索与下载
✓ 数据整理与标准化处理
✓ 差异表达分析
✓ 生存分析/ROC曲线
✓ 富集分析与可视化
✓ 文章思路与框架指导

交付成果

✓ 差异基因列表与注释
✓ 火山图、热图、森林图（矢量）
✓ 生存曲线与ROC图
✓ 富集分析结果
✓ 完整结题报告PDF
✓ 文章写作框架建议