常见问题

单细胞转录组：请提供Cell Ranger输出的原始目录（包含matrix、features、barcodes文件）或.h5格式文件。

常规转录组：请提供原始fastq文件或已比对的基因表达矩阵。

微生物组：请提供原始fastq测序数据（双端测序需R1/R2配对文件）。

代谢组：请提供原始质谱数据或已处理的表达矩阵。具体要求可在项目启动前与技术顾问确认。

常规转录组：建议每组至少3个生物学重复，最少不低于2个。

单细胞转录组：每个样本建议捕获细胞数≥3000，最低不低于1000。

微生物组：建议每组至少5个样本，以保障统计检验效力。

样本量不足时，我们会根据数据实际情况给出专业建议，部分分析可适当调整方案。

小文件（<2GB）：可通过企业微信、邮箱直接发送。

大文件：我们提供阿里云OSS临时上传链接，支持断点续传，单文件最大支持500GB。

传输过程中数据加密，确保传输安全。具体操作流程会在项目启动时由技术顾问指导。

单细胞分析基于Seurat（R）和Scanpy（Python）双引擎，比对定量使用Cell Ranger，轨迹分析使用Monocle3/Slingshot，细胞通讯使用CellChat。

所有分析流程均为标准化管线，交付物包含完整分析代码，结果完全可重复。

图表输出为PDF/SVG矢量格式，可直接用于SCI论文投稿。

可以。套餐内容为基础方案，可根据课题需求定制分析模块，如增加SCENIC转录因子调控分析、CytoTRACE细胞潜能评估、空间转录组联合分析等。

定制内容需额外评估工作量与费用，请微信咨询获取定制方案报价。

常规转录组/微生物组：5-10个工作日交付初稿。

单细胞转录组：10-15个工作日交付初稿（视样本数量和定制内容而定）。

GEO/TCGA数据挖掘：7-12个工作日。

加急服务可协商，需额外收取加急费用。具体周期在项目评估时确认。

当然可以。我们提供一对一技术对接，分析过程中会及时汇报关键节点（如质控结果、聚类分群等），您可随时提出调整意见。

初稿交付后还支持两轮免费微调，确保分析结果符合课题需求。

完整分析报告（PDF格式，含方法描述、结果解读、图表说明）

SCI标准矢量图（PDF/SVG格式，可直接用于投稿）

原始分析代码（R/Python脚本，结果可重复）

分析过程中间数据（如需）

所有交付物通过加密云盘提供下载链接，有效期30天。

可以。所有图表均按SCI期刊标准输出为矢量格式（PDF/SVG），分辨率无限放大不失真，字体、配色、尺寸均符合主流期刊要求。

如需按特定期刊格式调整（如Nature、Cell等），可在项目启动时告知，我们按目标期刊规范输出。

可以。初稿交付后支持两轮免费微调，包括图表样式调整、参数优化、补充分析等。

如需大幅修改分析方案或新增分析模块，可能需要额外评估费用。

付款方式：确认方案后支付50%预付款启动分析，交付验收后支付50%尾款。

支持对公转账、支付宝、微信支付等方式。

可开具增值税普通发票/专用发票，具体开票信息在项目启动时确认。

目前采用50%预付款+50%尾款模式，预付款到账后启动分析，确保双方权益。

长期合作客户可申请月结或季度结算，具体请微信咨询。

项目启动前签署正式保密协议（NDA），明确数据保密义务。

分析在独立隔离环境中进行，项目交付后原始数据彻底清除，不留存任何副本。

数据传输采用加密通道，存储使用加密云盘。

我们承诺绝不将客户数据用于任何其他用途。

绝对不会。每个项目独立运行，分析环境、代码、结果均为客户专属。

案例Demo页面展示的内容均为脱敏样板，不包含任何真实客户数据或结果。

不强制要求。您可以根据实际情况决定是否在致谢或方法部分提及Run2AI。

如需在方法部分描述分析流程，我们可提供标准化的方法学描述文本供参考。

所有交付的分析代码和参数设置均可直接用于论文方法部分的撰写。