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分析模板、数据提交指南、工具文档,一站式获取

数据提交指南

单细胞转录组

数据提交规范
  • -Cell Ranger输出目录结构说明
  • -h5文件格式要求
  • -样本信息表模板
  • -数据上传操作指引

常规转录组

数据提交规范
  • -fastq文件命名规范
  • -表达矩阵格式要求
  • -样本分组信息表模板
  • -数据质控自检清单

微生物组

数据提交规范
  • -16S/ITS双端测序数据要求
  • -引物序列信息表
  • -宏基因组数据提交规范
  • -样本元数据表模板

分析报告模板

单细胞转录组分析报告模板

完整标准化分析成果展示

包含从数据质控到细胞通讯分析全流程的报告框架,含方法学描述、结果解读模板、图表说明示例。

质控报告 降维聚类 细胞注释 差异分析 轨迹分析 细胞通讯
PDF格式 | 约30页

常规组学分析报告模板

转录组/微生物组/代谢组通用

涵盖转录组、微生物组、代谢组分析报告框架,含差异分析、富集分析、多样性分析等标准模块。

差异分析 火山图 富集分析 多样性 通路分析
PDF格式 | 约20页

工具与文档

S

Seurat标准分析流程

R语言 | v5.x

基于Seurat的标准化单细胞分析流程文档,涵盖质控、聚类、注释全流程代码模板。

Py

Scanpy标准分析流程

Python | v1.10+

基于Scanpy的Python单细胞分析流程文档,适合Python用户快速上手标准化分析。

D

DESeq2差异分析指南

R语言 | 转录组

DESeq2差异表达分析标准流程,含参数设置、结果解读、可视化代码模板。

Q

QIIME2微生物组分析指南

Python | 16S/ITS

QIIME2全流程分析文档,从数据导入到多样性分析、物种注释完整覆盖。

C

CellChat通讯分析指南

R语言 | 细胞通讯

CellChat细胞通讯互作分析流程,含配体-受体对推断、信号流图绘制方法。

M

Monocle3轨迹分析指南

R语言 | 拟时序分析

Monocle3拟时序分析标准流程,含轨迹学习、分支点识别、基因动态表达分析。

常用表格模板

样本信息表

Excel模板 | 通用

分组信息表

Excel模板 | 差异分析

保密协议模板

Word模板 | NDA

项目需求表

Excel模板 | 定制分析

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